肉雞設備養(yǎng)雞自然界存在大量有害微生物。孵化廠的廢棄物、蛋殼、絨毛等，加上孵化時的溫、濕度條件，又是其繁殖生長的良好環(huán)境，若不注意對孵化廠環(huán)境、孵化器具及種蛋的嚴格消毒，一旦疫病流行，將會帶來災難性后果。

肉雞設備廠家建議孵化廠環(huán)境應堅持每周1次消毒。常用的消毒藥品有：燒堿、新潔爾滅等，使用濃度分別為1%,0.3%-0.5%,5%。將消毒藥品按上述使用濃度對水噴灑。孵化廠應保持清潔。孵化廠嚴禁非工作人員人內，工作人員進人孵化廠也應經嚴格消毒、更衣后方可人內。

孵化器的消毒多采用甲醛熏蒸。一般每立方米空間用42毫升甲醛溶液加21克高錳酸鉀，在溫度20一2490，相對濕度70%一80%的條件下，密閉熏蒸30分鐘左右。

種蛋的消毒從雞體產出后越早越好，但生產上常采用一次集蛋后集中消毒。消毒的方法和使用的消毒藥很多，但常用的是用甲醛熏蒸。用量為每立方米空間甲醛28毫升、高錳酸鉀14克，熏蒸20一30分鐘。應特別注意的是：孵化24-%小時的種蛋，其胚胎對甲醛非常敏感，此時千萬不要使用甲醛熏蒸，若有必要消毒，可換為其他消毒藥品。

剛人孵和落盤后都應對孵化器及種蛋進行消毒，其方法和甲醛的用量基本同于對種蛋的消毒。應注意的是落盤后使用甲醛熏蒸的時間要短一些，一般10一15分鐘即可。

甲醛氣體對動物的黏膜有強烈的刺激性，使用時應注意自身的保護。每次消毒后應迅速排除孵化器、種蛋庫內的甲醛氣體。一些孵化廠曾嘗試過對剛出殼的雛雞進行甲醛熏蒸，以控制馬立克氏病和雞白痢。生產實踐證明，養(yǎng)雞設備養(yǎng)雞這種方法因甲醛濃度和熏蒸環(huán)境條件不易控制，稍有不慎，將導致雛雞失明，故不宜提倡使用。